146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1372 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  100 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  90.14 
 
 		 284 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  90.85 
 
 		 284 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  83.1 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  76.41 
 
 		 284 aa  454  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  72.54 
 
 		 284 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  72.89 
 
 		 284 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  49.11 
 
 		 286 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  47.33 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  50.76 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  49.01 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  51.14 
 
 		 282 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  44.33 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  51.15 
 
 		 282 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.83 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  46.15 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  46.29 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.83 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.99 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  47.49 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  48.41 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  49.8 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  48.16 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  45.99 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  45.49 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  42.18 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  45.21 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  44.36 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  43.98 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  39.58 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.63 
 
 		 290 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  46.36 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  42.47 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  44.28 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  36.93 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.15 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.6 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  32.53 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  30.2 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.1 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.41 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  35.1 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  33.09 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  33.1 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  33.1 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  30.62 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  29.43 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  25.44 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  26.48 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  25.86 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  27.07 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.65 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  29.92 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.57 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.83 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  27.53 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  25.86 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.18 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.29 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.88 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  26.4 
 
 		 336 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.41 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  28.4 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.2 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  22.63 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  23.35 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.29 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  25.61 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.1 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  22.78 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0928  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0947  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  25.2 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.85 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1840  UMP phosphatase  23.95 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000453857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  24.3 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  24.3 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55335  p-nitrophenyl phosphatase  22.03 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424742  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.03 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3557  HAD family hydrolase  23.01 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.16 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  23.43 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  23.43 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  23.43 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  23.43 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  23.43 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8074  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  28.03 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  23.43 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  23.43 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2762  UMP phosphatase  23.39 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  23.9 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  28.63 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3034  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.33 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  0.86283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>