163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0642 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  48.08 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  45.74 
 
 		 282 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  45.91 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  48.61 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  45.74 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  43.51 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  48.37 
 
 		 284 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  46.69 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  47.77 
 
 		 284 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  47.43 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.16 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  48.58 
 
 		 284 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  46.91 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  47.74 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  43.54 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  43.88 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  42.18 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  41.84 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  46.32 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  43.88 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.41 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  42.52 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  42.52 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  42.18 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.55 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  49.02 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  41.28 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  43.06 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  43.26 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  42.35 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.99 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  44.17 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  41.3 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  39.66 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  41.11 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.67 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  38.58 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.04 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.71 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  33.68 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  34.87 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  32.65 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  27.67 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  27.09 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  28.38 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  31.27 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.8 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.35 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.54 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  28.74 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  25.47 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.16 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.91 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.65 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  27.17 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  28.35 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2187  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.71 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0794654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  25.86 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  25.76 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  26.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.69 
 
 		 675 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33094  predicted protein  22.73 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.28 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.4 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0892  HAD superfamily hydrolase  24.52 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.65538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3321  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.31 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00782584  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2746  UMP phosphatase  25.62 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000506878  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  25.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  25.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  25.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1511  UMP phosphatase  25 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000195754  normal  0.444742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  25.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  25.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.17 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.33 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.76 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1840  UMP phosphatase  26.25 
 
 		 248 aa  50.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000453857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2581  UMP phosphatase  24.48 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>