151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2306 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  100 
 
 		 297 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  98.99 
 
 		 297 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  88.89 
 
 		 297 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  59.4 
 
 		 289 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  54.21 
 
 		 290 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  55.89 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  52.68 
 
 		 291 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  42.18 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  41.72 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  45.52 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  40.27 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  42.56 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  44.03 
 
 		 284 aa  222  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  44.91 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  44.19 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  45.98 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  41.81 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  43.98 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  39.26 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  39.86 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.22 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  40.2 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  39.8 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.2 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  41.53 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  40.88 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  37.67 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  41.76 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  40.27 
 
 		 295 aa  201  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.55 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  38.32 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  40.4 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  39.26 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  41.44 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  39.93 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  36.39 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.78 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  32.21 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  33.46 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  33.21 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  31.65 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.01 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  29.23 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  30.42 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  31.21 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  27.97 
 
 		 351 aa  96.3  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  30.87 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  29.12 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  24.84 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.09 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  25.93 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.59 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  26.22 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.35 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  27.45 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.39 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.8 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.44 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  29.62 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  27.89 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  26.92 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  21.22 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.24 
 
 		 338 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25.18 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.68 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.85 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.77 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  28.46 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  26.14 
 
 		 346 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1888  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.94 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  25.19 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25.18 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  24.11 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.57 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.56 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  23.24 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.63 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  27.31 
 
 		 353 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  22.54 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  22.54 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1362  hypothetical protein  44.44 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1907  HAD family hydrolase  27.38 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.69 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  22.54 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  22.54 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  22.54 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  22.54 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  22.54 
 
 		 254 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  23.83 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  24.71 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  25.33 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0233  HAD family hydrolase  25.3 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4780  HAD family hydrolase  22.54 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  25.33 
 
 		 259 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>