196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2563 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  100 
 
 		 280 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  45.88 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  43.37 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  41.64 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  41.5 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.88 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  39.36 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  32.43 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  35.86 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  39.77 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  35.95 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  33.09 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  33.46 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.09 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  31.99 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  29.82 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  29.76 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  32.86 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  35.69 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  32.53 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.92 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.92 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.98 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  30.65 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.27 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  39 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  30.24 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  34.08 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  31.99 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  30.86 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  33.07 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.95 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.38 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.38 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  32.4 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  30.03 
 
 		 351 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  34.31 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  27.97 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  33.48 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.46 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.64 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.01 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  32.16 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.05 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  32.84 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  27.71 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  27.71 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04360  4-nitrophenylphosphatase, putative  25.46 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  30.25 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.45 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3292  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1907  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3511  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.0582396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  29.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2698  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.8 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182106  normal  0.0745775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4076  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.44 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.125935  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3321  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.3 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00782584  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  29.88 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.03 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.81 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.58 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  32.79 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.03 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.61 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.338548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  28.4 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3498  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.58 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.622356  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  25.1 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.42 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.35 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  25.87 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2187  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.96 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0794654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.4 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.71 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.2 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  28.74 
 
 		 353 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  30.16 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.55 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.81 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2752  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  26.69 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  27.08 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  23.77 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>