More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3489 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  76.15 
 
 
436 aa  675    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  78.44 
 
 
434 aa  694    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  80.6 
 
 
432 aa  710    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
434 aa  874    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  74.43 
 
 
442 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
415 aa  333  5e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  37.23 
 
 
503 aa  256  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
418 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
418 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
439 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  33.66 
 
 
525 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
418 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
408 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  34.72 
 
 
405 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
431 aa  223  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
419 aa  219  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
421 aa  212  9e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
427 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
410 aa  211  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
409 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
417 aa  206  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
410 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  32.79 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
410 aa  192  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
439 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
377 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
421 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
425 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
470 aa  188  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
425 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  29 
 
 
436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
433 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 
454 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 
426 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 
419 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
456 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
458 aa  176  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
419 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
411 aa  173  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 
426 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
417 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
428 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
428 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
432 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 
423 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
426 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.12 
 
 
440 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 
419 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.84 
 
 
438 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
448 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
423 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
426 aa  170  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
423 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.42 
 
 
440 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
458 aa  168  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 
497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 
419 aa  166  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
421 aa  166  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
442 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
419 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 
420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
494 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 
415 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 
415 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.6 
 
 
438 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 
494 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 
449 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 
423 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 
420 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
505 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
424 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>