More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2655 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 437 aa  873    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  40.61 
 
 		 503 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  40.42 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  40.05 
 
 		 405 aa  272  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  35.99 
 
 		 525 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 434 aa  251  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 436 aa  249  5e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 415 aa  240  4e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 431 aa  196  7e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 410 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 409 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 421 aa  182  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 421 aa  172  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 409 aa  169  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 430 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  29.42 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 423 aa  160  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0009  histidyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.138679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  28.15 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  28.87 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 416 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 419 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 418 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 421 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 410 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 497 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 417 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0299  histidyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 456 aa  146  8.000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 426 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>