More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06491 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  90.38 
 
 
426 aa  785    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
426 aa  864    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  81.41 
 
 
429 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  96.48 
 
 
426 aa  838    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  60.05 
 
 
426 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 
423 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 
423 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 
430 aa  455  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
436 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 
429 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
429 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
435 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
430 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
429 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
429 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  41.92 
 
 
423 aa  350  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
427 aa  349  7e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
424 aa  348  8e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
426 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
425 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
424 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
424 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
428 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
425 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
424 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
422 aa  346  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
425 aa  346  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  45.34 
 
 
424 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
424 aa  346  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
425 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
424 aa  346  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
429 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
429 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
429 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
429 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
422 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
429 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
424 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
425 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
424 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
421 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
421 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
424 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
426 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
428 aa  342  5.999999999999999e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
429 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
426 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
424 aa  342  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
426 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
426 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
424 aa  342  8e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
424 aa  342  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
424 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
424 aa  341  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
426 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
424 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
424 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
424 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
424 aa  338  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
423 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
429 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
426 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
400 aa  335  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
419 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
424 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
419 aa  332  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
422 aa  332  8e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
423 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
414 aa  332  1e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
419 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
423 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
433 aa  331  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
419 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
423 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
423 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
423 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
423 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
426 aa  330  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
423 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
423 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>