More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1041 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  870    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  66.17 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  65.1 
 
 		 413 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 		 413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  61.35 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 414 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  59.61 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 417 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 414 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 414 aa  388  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  47.68 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  48.33 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  47.25 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 425 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  45.69 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>