More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0669 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  868    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 419 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 419 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 415 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 424 aa  388  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 414 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 426 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 418 aa  362  6e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 423 aa  356  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 421 aa  355  7.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 411 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 418 aa  353  5e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 429 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 421 aa  348  8e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.79 
 
 		 422 aa  346  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 403 aa  346  5e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 410 aa  345  6e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 429 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 429 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43.21 
 
 		 423 aa  339  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  43.1 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  45.54 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  44.85 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 420 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 420 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0653  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 434 aa  335  9e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>