More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1674 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
429 aa  862    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 
421 aa  448  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 
423 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
424 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
419 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
419 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
418 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
417 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  49.28 
 
 
422 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
423 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
421 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
418 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
418 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
414 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
414 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
418 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
416 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
416 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
423 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
420 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
426 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 
415 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
419 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
419 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
423 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
426 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
400 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
415 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
420 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
420 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
411 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
414 aa  368  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
413 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
413 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
423 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
421 aa  363  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
423 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
435 aa  360  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
424 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
429 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
417 aa  353  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
415 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
433 aa  352  8.999999999999999e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
424 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43.33 
 
 
423 aa  345  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
423 aa  345  8.999999999999999e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
419 aa  342  9e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
420 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
420 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
436 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
430 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
423 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  46.45 
 
 
424 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
417 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
430 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
423 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
410 aa  331  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
429 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
427 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
464 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
429 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
445 aa  326  5e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
430 aa  325  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
414 aa  324  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
424 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
425 aa  323  5e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
441 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
430 aa  322  7e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
431 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
414 aa  322  9.000000000000001e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  42.96 
 
 
421 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>