More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 464 aa  955    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 457 aa  571  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 440 aa  552  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0403  histidyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 413 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 415 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 413 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 419 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 414 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 423 aa  339  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 423 aa  335  7.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 423 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  42.53 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 421 aa  334  3e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.82 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 421 aa  333  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 419 aa  333  4e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 423 aa  333  5e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  43.05 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 420 aa  330  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 420 aa  330  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  43.86 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 429 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 418 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 423 aa  323  6e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 421 aa  319  7e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 426 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 420 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 424 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 424 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 422 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 420 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 415 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 429 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>