More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07281 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  875    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  63.66 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 423 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 436 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 430 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 445 aa  521  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 426 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  49.87 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  49.5 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 421 aa  363  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 425 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  47.63 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 424 aa  359  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 446 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 446 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 426 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 446 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>