More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1804 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  861    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 421 aa  461  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 419 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 426 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 424 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  401  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 417 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 446 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 430 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 446 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 446 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 446 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 446 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 446 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 446 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 428 aa  362  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 447 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 446 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 411 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>