More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3303 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  859    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 417 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 419 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 429 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  47.28 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 420 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  48.15 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 422 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  46.93 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 425 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 416 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  48.13 
 
 		 424 aa  362  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 429 aa  361  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 428 aa  359  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 429 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 418 aa  360  4e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 425 aa  359  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 424 aa  358  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 419 aa  358  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 425 aa  358  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>