More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2507 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  72.99 
 
 
423 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  72.75 
 
 
423 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  72.75 
 
 
423 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  72.99 
 
 
423 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  72.75 
 
 
423 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
423 aa  870    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  72.51 
 
 
423 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  72.51 
 
 
423 aa  654    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  72.75 
 
 
423 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  73.7 
 
 
423 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  72.51 
 
 
423 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  75.41 
 
 
426 aa  696    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  72.75 
 
 
423 aa  657    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 
424 aa  531  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 
420 aa  521  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 
420 aa  521  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
419 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
419 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  55 
 
 
419 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
433 aa  457  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
424 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
423 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 
420 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 
426 aa  432  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
417 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
420 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
418 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
425 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
421 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
430 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
426 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
433 aa  408  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
423 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
429 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
417 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
435 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
421 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
421 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
415 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
415 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
430 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
429 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
429 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
421 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
413 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  47.38 
 
 
422 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  47.76 
 
 
424 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
419 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
416 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
415 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
428 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
436 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
416 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.99 
 
 
423 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
430 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
413 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  45.99 
 
 
421 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
423 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
419 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
420 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
422 aa  375  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
421 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
445 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
441 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
414 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
419 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
447 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
423 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
457 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
411 aa  364  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 
418 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
418 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
429 aa  364  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
429 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
433 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
429 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
418 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
415 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 
418 aa  359  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
436 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
426 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
423 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
442 aa  358  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>