More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1184 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  78.92 
 
 
430 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  99.77 
 
 
429 aa  874    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
429 aa  876    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 
429 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  68.88 
 
 
435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 
436 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 
426 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
423 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
426 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
426 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
426 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 
423 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  49.28 
 
 
423 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
423 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
423 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
421 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
423 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
421 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
423 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
419 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
423 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
423 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
426 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
427 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
430 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
419 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
429 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
425 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
422 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
420 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
421 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
424 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
426 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
424 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
433 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
422 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
428 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
411 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
434 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
419 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
422 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
424 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
424 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
422 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
450 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
419 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
430 aa  372  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  48.24 
 
 
424 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
428 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
429 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
446 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
429 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
422 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
432 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
424 aa  368  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
446 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
425 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
429 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
446 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
429 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
450 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
424 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
446 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
424 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
429 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
425 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
424 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
424 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
446 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
424 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
424 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
446 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
424 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
420 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
446 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
426 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
423 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
446 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
424 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
424 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
446 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
423 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
425 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>