More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1310 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 433 aa  890    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 426 aa  475  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 415 aa  358  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 411 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 445 aa  351  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 423 aa  349  4e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 416 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 415 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 425 aa  349  7e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 415 aa  348  7e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 415 aa  348  9e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  43.2 
 
 		 424 aa  345  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 415 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 422 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 421 aa  341  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 429 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 429 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  40.14 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>