More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1453 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  855    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 419 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 418 aa  378  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 417 aa  358  9e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  47.33 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  45 
 
 		 422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 419 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 422 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 421 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 426 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 426 aa  348  8e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 423 aa  348  8e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 410 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 416 aa  346  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 415 aa  345  8e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  44.34 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 416 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 419 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 413 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 424 aa  339  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 425 aa  338  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>