More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3587 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  867    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 419 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 420 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 423 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 421 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 416 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 421 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  49.26 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 423 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  47.2 
 
 		 423 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  46.57 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 415 aa  363  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 442 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 435 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 423 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 425 aa  361  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 430 aa  358  9e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 429 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  46.19 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 429 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 429 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 432 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>