More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1726 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
420 aa  860    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  93.81 
 
 
420 aa  815    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 
419 aa  513  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
421 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
421 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
419 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
419 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
423 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
423 aa  408  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
423 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
423 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
423 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
423 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
423 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
423 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
423 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
426 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
421 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
419 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
416 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
416 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
420 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
417 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
418 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
415 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
421 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
418 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
413 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
418 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
429 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
419 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
413 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
420 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
419 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
417 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
417 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  45.12 
 
 
422 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
421 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
417 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
415 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
415 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
414 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
424 aa  363  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
400 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
426 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
423 aa  354  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
436 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
417 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
441 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
419 aa  350  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
406 aa  349  5e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
411 aa  348  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
429 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
414 aa  342  5.999999999999999e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
422 aa  342  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
422 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  42.42 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  43.3 
 
 
424 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
415 aa  333  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
415 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
422 aa  332  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
429 aa  332  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
424 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
424 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
420 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
430 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
424 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
424 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
424 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
414 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
424 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
424 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
424 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
425 aa  327  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
424 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  42.86 
 
 
424 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
424 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
424 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
424 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
424 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
429 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
425 aa  324  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
424 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
439 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0855028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>