More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3590 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
400 aa  829    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
419 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 
413 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
419 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 
413 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 
419 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
414 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
415 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
415 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
416 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
420 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
414 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
417 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
418 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
414 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
426 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
421 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
419 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
426 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
417 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
424 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
424 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
424 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
424 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
424 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
417 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  49.25 
 
 
423 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
429 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
424 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
424 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
424 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
424 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
417 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
424 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1934  histidyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 
439 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
419 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
421 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 
439 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0855028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
415 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
424 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  47.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
429 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
426 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  48 
 
 
422 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
422 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
424 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
423 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
423 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
424 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
422 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
424 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
424 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
415 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
415 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
423 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
429 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
427 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
420 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
423 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
426 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
416 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
422 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
424 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
420 aa  362  6e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  48.59 
 
 
424 aa  362  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
423 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
424 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
415 aa  360  3e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
423 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
414 aa  359  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
425 aa  359  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
421 aa  359  6e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
429 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
435 aa  358  9e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
424 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
419 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
429 aa  355  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>