More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0564 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 406 aa  819    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 415 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 413 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 419 aa  362  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 419 aa  359  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 420 aa  349  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 414 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 417 aa  345  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 417 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  44.74 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 420 aa  342  8e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.61 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 416 aa  339  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1934  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0855028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 422 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 418 aa  332  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 429 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 415 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 426 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 426 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 426 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 415 aa  328  8e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 427 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  43.41 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.44 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 423 aa  325  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 415 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>