More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1934 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 439 aa  889    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0855028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1934  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 439 aa  889    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  56.57 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  53.16 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  53.63 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2195  histidyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 446 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>