More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1261 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 410 aa  831    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 421 aa  346  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 410 aa  346  4e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 414 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 411 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 419 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 415 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 435 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 408 aa  339  5.9999999999999996e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 403 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 409 aa  334  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 414 aa  334  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 426 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 426 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  41.92 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 419 aa  328  8e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  39.29 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0855028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1934  histidyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 417 aa  326  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 426 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 417 aa  322  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 426 aa  322  9.000000000000001e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  40.83 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 417 aa  319  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 430 aa  319  7e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 419 aa  319  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 423 aa  316  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2195  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>