More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0894 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 409 aa  832    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  70.9 
 
 		 410 aa  598  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  67.24 
 
 		 408 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  62.81 
 
 		 408 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 		 408 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 403 aa  488  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 413 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 410 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 414 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 417 aa  329  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 435 aa  325  6e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 429 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 416 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 425 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 424 aa  319  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 426 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 446 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 446 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 415 aa  309  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 427 aa  309  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 442 aa  308  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  38.92 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 426 aa  306  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 429 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 429 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 429 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 430 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 429 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 429 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 429 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>