More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1288 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 402 aa  830    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 403 aa  548  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 409 aa  501  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 410 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 408 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 408 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 413 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 415 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 414 aa  352  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 416 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 416 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 426 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 419 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 424 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 417 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  43.9 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 435 aa  324  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 414 aa  324  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 421 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 419 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 424 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 415 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 419 aa  318  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 422 aa  315  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 422 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 414 aa  315  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  40.94 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 424 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 425 aa  313  4.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 431 aa  312  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 446 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>