More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0925 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 410 aa  834    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  70.9 
 
 		 409 aa  598  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  68.22 
 
 		 408 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 408 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 408 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 408 aa  498  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 403 aa  478  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 402 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 414 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 410 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  345  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 415 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 413 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 413 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 419 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 425 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 419 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 423 aa  318  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 422 aa  316  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 429 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 417 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 422 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0855028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1934  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 419 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 435 aa  309  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 429 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2195  histidyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 448 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 417 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 426 aa  305  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  38.41 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 400 aa  303  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 424 aa  302  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  37.78 
 
 		 423 aa  301  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>