More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3608 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  867    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  87.5 
 
 		 424 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  83.73 
 
 		 424 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  83.49 
 
 		 424 aa  744    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  84.63 
 
 		 424 aa  759    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  83.25 
 
 		 424 aa  743    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  749    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  73.05 
 
 		 424 aa  650    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  81.32 
 
 		 424 aa  724    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  83.49 
 
 		 424 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  79.91 
 
 		 424 aa  722    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  83.96 
 
 		 424 aa  749    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  87.74 
 
 		 424 aa  775    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  87.74 
 
 		 424 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  73.16 
 
 		 422 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  84.87 
 
 		 424 aa  758    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  83.49 
 
 		 424 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  749    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 424 aa  749    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  70.21 
 
 		 422 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  69.5 
 
 		 422 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0009  histidyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 430 aa  588  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.138679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 424 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 448 aa  586  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  65.57 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 426 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 426 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 426 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 426 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 426 aa  554  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  63.15 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 428 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  61.5 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  60.24 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 428 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  60.75 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 426 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 426 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 426 aa  488  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 419 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2195  histidyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 456 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>