More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1136 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
414 aa  836    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 
414 aa  522  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
419 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
419 aa  388  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
416 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
414 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
413 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
413 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
416 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
415 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
420 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
417 aa  362  9e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
417 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
419 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
400 aa  359  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
418 aa  358  8e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
419 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
419 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
421 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
420 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
421 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
406 aa  346  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
415 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
419 aa  346  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
423 aa  346  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
420 aa  346  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
426 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
424 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
417 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
423 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
420 aa  342  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
421 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
415 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
420 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
420 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
426 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
414 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
423 aa  339  5e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
422 aa  338  7e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43.21 
 
 
423 aa  338  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
423 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.86 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
417 aa  336  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
428 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
423 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
410 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
424 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
423 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
424 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
424 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
423 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  43.2 
 
 
424 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
423 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
424 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
424 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
424 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
424 aa  333  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
424 aa  333  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
418 aa  332  6e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
423 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
423 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
421 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
423 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
423 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
423 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
423 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
423 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
419 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
411 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
424 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
424 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
424 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
427 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
415 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
429 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
424 aa  329  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
429 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
423 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
426 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
429 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
424 aa  326  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
429 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
429 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
424 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
424 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
426 aa  325  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>