More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2445 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  86.13 
 
 		 415 aa  714    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 414 aa  832    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  97.34 
 
 		 426 aa  793    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  99.03 
 
 		 414 aa  828    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 424 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  46.73 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 430 aa  364  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 422 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 424 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 457 aa  363  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 424 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 422 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  49.12 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 414 aa  361  1e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 428 aa  361  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  45.91 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 419 aa  359  6e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  355  8.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 417 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 423 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 415 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 418 aa  350  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 432 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 426 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 410 aa  349  4e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 450 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>