More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0811 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  100 
 
 		 422 aa  878    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  391  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 421 aa  378  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 413 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 421 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 420 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 400 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 415 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 415 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 413 aa  358  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 433 aa  353  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 424 aa  352  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 464 aa  345  6e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 429 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  42.11 
 
 		 421 aa  345  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 424 aa  343  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 417 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 419 aa  342  9e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 420 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 429 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 428 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 448 aa  338  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>