More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2228 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 430 aa  881    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 426 aa  548  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 426 aa  543  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  46.48 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 421 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 445 aa  362  6e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 426 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 422 aa  362  9e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 424 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 424 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 424 aa  359  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  44.82 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.64 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 424 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 425 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 423 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 424 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>