More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1830 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 433 aa  885    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 425 aa  610  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 423 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 413 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 419 aa  355  8.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 413 aa  352  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 415 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 414 aa  342  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 416 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 426 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 419 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 424 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 424 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  39.47 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  40.4 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.74 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 426 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  322  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 411 aa  319  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 420 aa  318  9e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>