More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0859 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  875    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 429 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 435 aa  352  5e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 418 aa  338  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 419 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 421 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 426 aa  325  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  38.82 
 
 		 422 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 420 aa  323  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 419 aa  319  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 414 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 436 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 420 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 424 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 420 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 426 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  40.44 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 429 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 413 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  306  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 424 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 423 aa  305  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>