More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 436 aa  879    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  69.61 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  72.14 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 426 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  53.86 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  50.95 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 424 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>