More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0188 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  77.99 
 
 
430 aa  679    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
445 aa  892    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  72.14 
 
 
436 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 
423 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 
423 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  62.01 
 
 
435 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
429 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
429 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
430 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
426 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 
429 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
426 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
426 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 
423 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
424 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
426 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
428 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
429 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 
429 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
428 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
425 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
429 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
427 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
429 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
425 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  49.3 
 
 
423 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 
427 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
429 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
424 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  50.85 
 
 
424 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
425 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
425 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
425 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
426 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
426 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
432 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
450 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
426 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
426 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
426 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
426 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
424 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
429 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
424 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
424 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
424 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
424 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
446 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
424 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
422 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
424 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
424 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
424 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
424 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
419 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  48.96 
 
 
424 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
424 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
426 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
424 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
424 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
446 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
424 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
423 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
419 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
429 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
424 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
446 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
424 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
424 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
450 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
424 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
448 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
426 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
422 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
429 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
419 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
429 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
433 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
446 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
446 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
422 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
429 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
446 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
425 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
424 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>