More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0220 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 430 aa  870    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  77.99 
 
 		 445 aa  667    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  69.61 
 
 		 436 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 423 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  52.21 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 428 aa  401  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 450 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 422 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  51.11 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 419 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 446 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>