More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0061 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  870    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  96.93 
 
 		 423 aa  844    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  63.66 
 
 		 423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 436 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 430 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 445 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 426 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 426 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  49.06 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 422 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  46.8 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  45.32 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>