More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2085 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  81.57 
 
 		 432 aa  744    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  76.19 
 
 		 446 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  75.51 
 
 		 446 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 		 446 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  80.65 
 
 		 450 aa  742    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 456 aa  932    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 		 446 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  75.74 
 
 		 446 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  80.65 
 
 		 450 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  74.32 
 
 		 446 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  74.6 
 
 		 446 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 		 446 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  73.92 
 
 		 446 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  74.32 
 
 		 446 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  88.21 
 
 		 447 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  75.45 
 
 		 446 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  75.96 
 
 		 446 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 		 446 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  74.6 
 
 		 446 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  75.45 
 
 		 446 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 		 446 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  75.96 
 
 		 446 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  76.19 
 
 		 446 aa  704    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  68.47 
 
 		 442 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  67.42 
 
 		 442 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  64.79 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 		 461 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 429 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2306  histidyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0921462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1873  histidyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1995  histidyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2607  histidyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  56.54 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2188  histidyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 		 440 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  53.88 
 
 		 423 aa  478  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 422 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 425 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 424 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 424 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  54.85 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>