More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2306 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  75.93 
 
 		 429 aa  666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  75.93 
 
 		 429 aa  668    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2306  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 437 aa  889    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0921462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  73.18 
 
 		 431 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  70.33 
 
 		 461 aa  627  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1873  histidyl-tRNA synthetase  71.33 
 
 		 456 aa  623  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  68.85 
 
 		 433 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2607  histidyl-tRNA synthetase  70.5 
 
 		 452 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  69.23 
 
 		 441 aa  610  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1995  histidyl-tRNA synthetase  63.57 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2188  histidyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 		 440 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 447 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 450 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 		 446 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 446 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 442 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  55.39 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  54.27 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 425 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 423 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  50.12 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 425 aa  415  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 429 aa  415  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>