More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2189 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
415 aa  851    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  99.52 
 
 
415 aa  847    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
418 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
417 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
419 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
419 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 
417 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
421 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
423 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
426 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
423 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
419 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
424 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
420 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
421 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
424 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
423 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  391  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
420 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
423 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
420 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 
430 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
400 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
414 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
415 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
423 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
419 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
416 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
413 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
416 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
423 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
420 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
421 aa  382  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
419 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
419 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
420 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
420 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
413 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
429 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
435 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
414 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
414 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
433 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.52 
 
 
422 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
421 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
425 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
418 aa  364  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
421 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
425 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
426 aa  361  1e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
424 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
426 aa  358  9e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  44.17 
 
 
424 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
415 aa  354  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  41.03 
 
 
423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
417 aa  352  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
418 aa  352  7e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
426 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
426 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
426 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
426 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
406 aa  350  4e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
425 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
425 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
424 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
426 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
425 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
424 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
423 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
429 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
425 aa  345  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
429 aa  345  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
419 aa  345  8e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
417 aa  345  8e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
423 aa  344  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
457 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 
426 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
429 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
423 aa  342  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
424 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
424 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
424 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
427 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
424 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
424 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
429 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
424 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
424 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>