More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2108 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  884    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  82.55 
 
 		 426 aa  705    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 422 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 445 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 416 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 423 aa  362  8e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  41.47 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 419 aa  360  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  42.48 
 
 		 423 aa  358  7e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 415 aa  358  9e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 400 aa  356  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 424 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 421 aa  355  7.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 424 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 424 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.42 
 
 		 422 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 415 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  44.62 
 
 		 424 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>