More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1848 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  873    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 433 aa  589  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 424 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 420 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 420 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 430 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 417 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 419 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 415 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 423 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 420 aa  349  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 445 aa  348  7e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 417 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 430 aa  335  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 413 aa  335  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 416 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 416 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 414 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 423 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 413 aa  332  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 419 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 419 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  38.72 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  41.4 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 424 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 418 aa  326  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 423 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 419 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 423 aa  322  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 446 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 446 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 446 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>