More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1013 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 411 aa  831    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 415 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 415 aa  484  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 419 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1076  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 422 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 426 aa  349  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 410 aa  345  8.999999999999999e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 429 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 414 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 429 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 426 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 427 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 414 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 427 aa  335  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 414 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  44.6 
 
 		 424 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 413 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 423 aa  332  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 424 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 433 aa  332  9e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 415 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 426 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 429 aa  329  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 432 aa  329  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 423 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  43 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 442 aa  328  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>