More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2531 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 415 aa  830    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  75.47 
 
 		 431 aa  564  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  71.01 
 
 		 419 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 411 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1076  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 413 aa  350  3e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  46.51 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 422 aa  348  7e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 424 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.5 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 425 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 424 aa  338  8e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 424 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 423 aa  335  7e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 429 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 424 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2188  histidyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 440 aa  332  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 425 aa  332  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 429 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 423 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 430 aa  328  9e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 427 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 461 aa  326  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 427 aa  325  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 414 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 431 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  45.48 
 
 		 424 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>