More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0781 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
413 aa  847    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1076  histidyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
415 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
413 aa  335  1e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
411 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
415 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 
419 aa  328  8e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
413 aa  322  7e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
423 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
419 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
429 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
429 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
433 aa  297  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
419 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  38.57 
 
 
423 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
426 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
419 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
428 aa  292  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
429 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
419 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
417 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
421 aa  290  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
420 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
430 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
424 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
435 aa  288  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
431 aa  288  9e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
446 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
417 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
442 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
426 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  38 
 
 
422 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
442 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
417 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
420 aa  286  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
446 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
415 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
414 aa  286  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
446 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
446 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
446 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
446 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
446 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
446 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
446 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
416 aa  282  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
424 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
419 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
430 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
447 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
426 aa  282  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
424 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
416 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
417 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
424 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
446 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
424 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
424 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
424 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
424 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
424 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
430 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
424 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  36.41 
 
 
424 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
424 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
446 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
414 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
424 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
420 aa  280  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
429 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
423 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
423 aa  279  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
423 aa  279  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
429 aa  279  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
426 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
415 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
424 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
424 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>