More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1786 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
430 aa  872    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  74.07 
 
 
429 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 
429 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 
430 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  66.98 
 
 
425 aa  597  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  68.51 
 
 
434 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  69.71 
 
 
422 aa  585  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
436 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
429 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
419 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
429 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
429 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
435 aa  362  9e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
430 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
419 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
423 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
436 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
426 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
430 aa  346  5e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
420 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
423 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
415 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
424 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
421 aa  338  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
426 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
421 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
423 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
423 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
423 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
423 aa  332  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
423 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
423 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
424 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
421 aa  330  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
421 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
423 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
423 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
423 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
423 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
411 aa  329  6e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
442 aa  329  7e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
423 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
423 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
429 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
431 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
423 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
419 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
445 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
419 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
433 aa  324  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
447 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
413 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  42.82 
 
 
423 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  41 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
420 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
432 aa  319  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
419 aa  318  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
446 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
415 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
422 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  41 
 
 
426 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
429 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  41.39 
 
 
422 aa  316  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
424 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
418 aa  316  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
423 aa  315  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
429 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
420 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
416 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
420 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
420 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
446 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 
426 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
416 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
446 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 
446 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
446 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
427 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
446 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>