More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0027 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 417 aa  850    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  77.56 
 
 		 426 aa  631  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  71.22 
 
 		 417 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  65.62 
 
 		 416 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 414 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  49.28 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 421 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  47.75 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 421 aa  368  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 422 aa  362  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 435 aa  361  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 423 aa  357  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 402 aa  356  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  46.23 
 
 		 424 aa  356  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 417 aa  356  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 424 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 420 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 424 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 428 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 419 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0855028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1934  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 420 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 423 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>