More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0289 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  837    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  70.74 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  71.01 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 411 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1076  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 408 aa  346  4e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 410 aa  319  7e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 422 aa  316  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 429 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 425 aa  308  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 429 aa  308  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 425 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2195  histidyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 430 aa  305  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  40.93 
 
 		 423 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  42.23 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 428 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  300  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 429 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 426 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 426 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 424 aa  299  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 424 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  48.47 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 417 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 426 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 461 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 426 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 426 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 426 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 426 aa  292  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 413 aa  290  2e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>