More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1619 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 436 aa  876    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 430 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 420 aa  348  9e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  46.1 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 413 aa  342  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.84 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 421 aa  340  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 415 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  46.96 
 
 		 421 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  43.4 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 429 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 418 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 416 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 414 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 428 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 446 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 446 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>